De vernietiging van ziekteverwekkers of andere schadelijke stoffen die het lichaam zijn binnen gekomen door middel van insluiting. Fagocytose wordt uitgevoerd door speciale witte bloedcellen, de fagocyten of macrofagen. De macrofaag fagocyteert de pathogeen en breekt deze met speciale spijsverteringssappen uit de lysosomen af.